海军罪案调查处

空军一号核武士官在和总统共进午餐之后突然抽搐身亡。海军犯罪调查处（NCIS）的吉布斯奉命来调查死因。FBI、特勤局等机构在空军一号上各执一词，吉布斯等人瞒天过海抢得先机，开始全面调查。正当事情一筹莫展，又有一名海军上尉在自己的车里死去。

凯特•陶德从特勤处辞职加入到了海军犯罪调查处，一名正在跳伞海军陆战队士兵坠车而死。后续调查发现士兵的降落伞被人为破坏，凶手很可能是他一起跳伞的战友。

一群大学生在海滩聚会，却听到海面上有枪声，随后一条空的、布满弹孔的摩托艇冲上了海滩，紧接著有一具尸体冲上海滩。案件表面是毒贩的争斗，但牵扯出的竟然是针对美国电网的恐怖袭击。

一名潜水的年轻人在珊瑚礁附近发现了一具衣冠济济的海军尸体，经过调查其在福斯特号上服役。吉布斯带着凯特和托尼来到军舰调查，而托尼在波多黎各的调查发现了更大的秘密，决斗从虚拟升级为现实，这个新兵混淆了现实和虚拟的界限。

一名在马利兰州国家公园打猎的猎人，无意中发现了一个F-14雄猫战斗机的外挂油箱，里面有一具已经成了木乃伊的海军中尉。经过调查，这个名叫舒尔茨的中尉是个卷走120万海军军费的嫌疑犯。

一个海军士兵休假期间在酒吧发狂，海军怀疑他吸毒可是没有证据，吉布斯受以前的队员斯坦邀请前来调查，托尼面对吉布斯对斯坦的欣赏心有醋意。

一具尸体在盐酸桶里被泡得面目全非，唯一的身份识别是他身上一处疑似潜艇兵的纹身，吉布斯怀疑有人冒名顶替，他带着凯特进了潜艇，托尼和诺福克办事处新人麦基合作在嫌疑人的房子发现惊人秘密。Mcgee第一次出现，这是个拥有麻省理工计算机硕士和约翰霍普金斯大学生物工程科系的天才。

一名路人拦车却险些被撞，当愤怒的路人试图把司机拽出来时却发现司机已经死亡，死因却是被其吞咽的宝石所杀。事件牵扯到关塔那摩的NCIS人员。